В связи с проведением административной реформы, на основании приказа руководителя Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека от 20.12.2004 № 35 "О создании территориальных органов Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека" создано Территориальное управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Брянской, сокращенное название – Управление Роспотребнадзора по Брянской области.
  Далее на основании приказа руководителя Роспотребнадзора от 21.01.2005 г. № 37 "О реорганизации территориальных органов Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека" осуществлена реорганизация в форме слияния Территориального управления Роспотребнадзора по Брянской области и Территориального управления Госторгинспекции по Брянской области.
  Приказом Руководителя Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека от 20.07.2006г. № 217 "Об утверждении положения об Управлении Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Брянской области" внесены изменения в положение, а также в наименование учреждения. Полное наименование – Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Брянской области. Сокращенное наименование - Управление Роспотребнадзора по Брянской области.
  В своей деятельности Управление руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, указами и распоряжениями Президента РФ, постановлениями и распоряжениями Правительства РФ, международными договорами РФ, актами Министерства здравоохранения и социального развития РФ, положением о Федеральной службе, актами Федеральной службы и Положением об Управлении Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Брянской области (утверждено приказом Роспотребнадзора от 20.07.2006г. № 217).
   В структуру Управления Роспотребнадзора по Брянской области входят: отдел санитарного надзора, отдел эпидемиологического надзора, отдел по надзору в сфере защиты прав потребителей, отдел организации надзора, отдел бухгалтерского учета и отчетности, Отдел юридического обеспечения, государственной службы и кадров, а также 7 территориальных отделов, осуществляющих функции по контролю и надзору на административных территориях.